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					實(shí)驗(yàn)室儀器
				
				按功能分
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 - 2. 粉碎機(jī)
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 - 計(jì)量儀器
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按專業(yè)實(shí)驗(yàn)室分- 化學(xué)合成
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新成果:5小時(shí)可創(chuàng)建脂類串聯(lián)質(zhì)譜譜庫
[2015/1/30]
來自美國和日本的科學(xué)家僅僅耗時(shí)五個(gè)小時(shí)就建立了一類新發(fā)現(xiàn)的脂質(zhì)的串聯(lián)質(zhì)譜(MS/MS)譜庫。一般而言,建立這樣一個(gè)譜庫需要更長的時(shí)間,科學(xué)家使用了一款新研發(fā)的軟件縮短了研究時(shí)間。這是一款從化學(xué)結(jié)構(gòu)推測質(zhì)譜圖的軟件工具。
該軟件被稱為LipidBlast,是由Oliver Fiehn和他的同事們?cè)诩又荽髮W(xué)研發(fā)的。Davis去年在《Nature Methods》雜志發(fā)表了一篇論文將此軟件首次公開。LipidBlast創(chuàng)建一個(gè)特定類別脂質(zhì)的質(zhì)譜庫的步驟是:首先,分析這類脂質(zhì)中已知成員的化學(xué)結(jié)構(gòu)。然后,使用這些信息來推測具有相似結(jié)構(gòu)的此類物質(zhì)的其它可能成員。接下來,此軟件將部分已知成員的化學(xué)結(jié)構(gòu)與之前研究得到的已知成員的串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)相關(guān)聯(lián)。最后,它利用這些關(guān)系來確定含有已推測成員在內(nèi)的所有其余成員的MS/MS譜圖,包括母離子和子離子。一經(jīng)驗(yàn)證,通過對(duì)比實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和檢索MS/MS譜庫,得到的譜庫就可以用于鑒別LC-MS/MS分析的生物樣品中的這些物質(zhì)。
此軟件靈活性很強(qiáng)
由于脂類在串聯(lián)質(zhì)譜中容易形成可預(yù)知的碎片,所以尤其適合此軟件電腦譜庫的創(chuàng)建。而且,LipidBlast非常靈活,足以應(yīng)付推測正、負(fù)離子下或不同的外加電壓下的MS/MS譜圖。在建立譜庫時(shí),這種靈活性使得它能夠利用40種高或低分辨率質(zhì)譜儀的譜圖,包括三重四極桿質(zhì)譜儀和傅里葉變換質(zhì)譜儀。
Fiehn和他的同事利用LipidBlast 建立了一個(gè)基本演示MS/MS譜庫,包含212,516張譜圖,覆蓋26種脂類物質(zhì)的119,200種化合物。這些化合物包括磷脂類、甘油脂類、細(xì)菌脂聚糖類和植物糖脂類。他們已經(jīng)使用這個(gè)庫來識(shí)別了藻類、有鞭毛的原生生物和哺乳動(dòng)物干細(xì)胞中的脂質(zhì)。
能應(yīng)對(duì)低磷水平的脂類家族
最近,F(xiàn)iehn已將注意力轉(zhuǎn)移到了一類特殊的脂類−葡萄糖醛酸糖脂(glucuronosyldiacylglycerol,GlcADG)。它是近期日本科學(xué)家從植物中發(fā)現(xiàn)的一種脂類。由于GlcADG可以代替植物細(xì)胞膜上的磷脂,所以可以幫助植物應(yīng)對(duì)低磷水平。雖然這種脂類首先在植物中發(fā)現(xiàn),但它也可能出現(xiàn)在細(xì)菌、真菌和藻類等其他生物中。
為了與最初發(fā)現(xiàn)這類脂質(zhì)的日本科學(xué)家們一起在其它有機(jī)體中尋找這類脂質(zhì),F(xiàn)iehn和他的一位同事使用LipidBlast創(chuàng)建了一個(gè)GlcADG類的MS/MS質(zhì)譜庫。照例,這需要利用日本科學(xué)家先前得到的MS/MS譜圖和植物中GlcADG類物質(zhì)的化學(xué)結(jié)構(gòu),以及相似脂類成員的化學(xué)結(jié)構(gòu)。最終的譜庫包含15,000 張MS/MS譜圖,建成僅耗時(shí)5小時(shí)。
“這項(xiàng)工作不僅有希望通過GlcADG來擴(kuò)展已知有機(jī)體的范圍,而且也從另一個(gè)方面體現(xiàn)了LipidBlast快速創(chuàng)建MS/MS譜庫的能力”,F(xiàn)iehn說。他們還開發(fā)了應(yīng)用于新型脂類的免費(fèi)模板,用來鼓勵(lì)其他研究人員使用這款軟件。
							
							
							
							 
							
							
							
							
							 
							
							
							
							 
							
							
							
							
							 
							
							
							
							
							 
							
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